उच्च तापमान दहन ट्यूब में, नमूना उच्च तापमान उत्प्रेरक ऑक्सीकरण से गुजरता है, जो कार्बनिक और अकार्बनिक कार्बन दोनों को कार्बन डाइऑक्साइड में परिवर्तित करता है। कम तापमान वाली प्रतिक्रिया ट्यूब में, नमूना अम्लीकृत होता है, और अकार्बनिक कार्बन कार्बन डाइऑक्साइड में विघटित हो जाता है। दोनों प्रतिक्रिया ट्यूबों में उत्पादित कार्बन डाइऑक्साइड को फिर वाहक गैस द्वारा गैर-फैलाने वाले अवरक्त गैस डिटेक्टर (एनडीआईआर) में पता लगाने के लिए ले जाया जाता है। यह पानी के नमूने में कुल कार्बन (टीसी) और अकार्बनिक कार्बन (आईसी) को अलग-अलग मापने की अनुमति देता है। कुल कार्बन और अकार्बनिक कार्बन के बीच का अंतर कुल कार्बनिक कार्बन (टीओसी) है, अर्थात, टीओसी = टीसी - आईसी।
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